目前实验室投入使用的大型仪器设备总计26台件。大型仪器涵盖了用于昆虫行为学研究的厘米波垂直昆虫雷达、毫米波扫描昆虫雷达、高空气象探测系统、超速分析仪、气质联用系统和高效液相色谱仪等;用于基因组学研究的实时荧光定量PCR仪、高分辨率熔点分析系统、毛细管电泳仪、核酸蛋白扫描检测系统和多功能扫描仪等;用于蛋白质组学研究的快速蛋白液相系统、多功能酶标仪、生物分子互作检测系统、液相芯片检测系统和生物反应器等,以及超速离心机、激光共聚焦显微镜、冷冻干燥机、倒置荧光显微镜等通用大型仪器设备。基此,整合形成了6个科研平台:农业昆虫学研究公共平台、植物病害研究公共平台、重大迁飞性害虫的监测预警研究公共平台、转基因生物安全研究公共平台、生物入侵机制与防控研究公共平台和功能基因组学研究公共平台。